全基因體定序
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「台灣首次珊瑚全基因體定序」登國際期刊 有助保護海洋生態系
珊瑚礁生態系孕育著豐富的海洋資源，對於維護生物多樣性十分重要，國立臺灣海洋大學海洋環境與生態研究所所長識名信也教授近期與東京大學(UTokyo)大氣海洋研究所新里宙也(Chuya Shinzato)副教授及沖繩科學技術大學院大學（OIST）佐藤矩之(Noriyuki Satoh)教授合作，成功解開一種石珊瑚-錨形紋葉珊瑚（Fimbriaphyllia ancora）的基因體，將能更有效地養殖珊瑚及推進復育，相關研究成果並發表在《Nature》的子期刊《Communications Biology》(通訊生物學)。識名信也教授與東京大學大氣海洋研究所新里宙也副教授及沖繩科學技術大學院大學佐藤矩之教授合作，成功解開錨形紋葉珊瑚的基因體，將能更有效地養殖珊瑚及推進復育。（圖／海洋大學提供）本次研究也是台灣首次於國際發表珊瑚基因體。識名教授表示：「透過運用研究的基因體資訊，不僅能改進此珊瑚的養殖技術，也能更有效地推進保育復育活動。」近年隨著全球珊瑚數量的減少，國際間對於珊瑚的基礎研究、培育及養殖以及海洋保育活動的關注度不斷提升。基因體被稱為生命的設計圖，包含生物體生長和運作所需的資料，若能詳細解開基因體的資訊，就能更加深入了解珊瑚的生物學特徵，進而優化養殖技術並提高保育復育活動的效率。石珊瑚是珊瑚礁生態系的主要建構者，錨形紋葉珊瑚為一種廣泛分布於印太地區的石珊瑚，不僅在觀賞水族珊瑚市場上具有較高的經濟價值，近年來也成為研究珊瑚有性生殖的重要模式物種。識名教授自2018年起，與新里宙也副教授（東京大學）及佐藤矩之教授（OIST）共同開始此珊瑚的基因體解析工作。研究團隊並在研究中發現珊瑚的不同組織各自擁有不同的基因群，扮演著珊瑚生理功能的多樣角色，這也是全球性的創舉。隨著全球氣候變遷、海水酸化與溫度上升，珊瑚面臨著嚴峻的生存挑戰，美國國家海洋暨大氣總署(NOAA)日前也對外公布，全球正在經歷第四次大規模珊瑚白化。透過珊瑚基因體分析所揭示的種群結構和遺傳多樣性，將有助於準確理解不同珊瑚物種的環境需求，並推進珊瑚的保護與復育活動。識名教授並表示，將持續與國內外研究機構和大學合作，為臺灣的珊瑚研究發展作出貢獻。
今年副傷寒病例創10年新高！ 全台累積22例本土「曾吃生蠔、生魚片」
愛吃生食的民眾注意！疾管署於28日表示，國內2023年已發現22例本土副傷寒確定病例，創下十年同期來新高，且部分個案都有生食或食用未充分煮熟的食物，如生蠔、生魚片等。對此，疾管署表示已啟動專案調查，針對菌株進行全基因體定序分析比對，同時針對本土確診個案進行更詳細飲食等暴露史之疫調，以釐清可能感染源。同時也呼籲民眾，應隨時注意飲食及手部清潔，並保持良好個人衛生習慣，避免生飲生食。依疾管署統計資料顯示，2023年截至11月27日止，副傷寒確定病例累計23例，分別為22例本土及1例印尼境外移入病例。本土病例均為本國籍，男性15例（68%），女性7例（32%），年齡介於10多歲至50多歲，以20至29歲為多（50%），居住地分布於11個縣市，發病時間則分散於各月份，其中以10月份8例為最多。而2018至2022年本土累積病例數分別為1、3、0、1、6例，境外移入病例數分別為7、6、0、0、0例，其中2018及2019年境外移入病例感染國家分別為印尼(4例)、印度(4例)、柬埔寨(2例)、緬甸(1例)、孟加拉(1例)及美國(1例)。疾管署說明，副傷寒為第二類法定傳染病，是由副傷寒桿菌引起之腸道傳染病，主要透過食用受病患或帶菌者糞便或尿液污染的食物或飲水而傳播，潛伏期通常為1至10天，可傳染期為1至2週，常見的症狀有持續性發燒、頭痛、不適、厭食、腹痛、腹瀉、相對性心搏過緩或軀幹出現紅疹等。呼籲民眾隨時注意飲食及手部清潔，並保持良好個人衛生習慣，避免生飲生食，食物須經過充分加熱煮熟後才可食用，烹調及製備過程亦應避免生熟食交叉污染；應飲用煮沸後的水或瓶裝礦泉水；保持良好個人衛生習慣，飯前、便後、處理食物前或更換尿片後，應正確使用肥皂及清水澈底清潔雙手，才能有效防範。疾管署強調，民眾如出現疑似症狀，請儘速就醫並告知飲食史；醫療院所如發現疑似個案，請於24小時內通報。
遠大洋洲居民祖先源自台灣？ 科學期刊：台灣原住民5000年前曾遷徙
近日有科學團隊在全球權威科學學術期刊《自然》（Nature）發表研究報告，內容中表示，在追蹤基因後，發現如今遠大洋洲的居民的祖先，極有可能是台灣原住民，推斷台灣原住民曾於5000年前向外遷徙。根據《自然》的研究報告指出，遠古人類離開非洲後，約4.5萬年前就定居在巴布亞紐幾內亞（Papua-New-Guinea）、俾斯麥群島（Bismarck archipelago）和索羅門群島等近大洋洲（Near Oceania）等區域。但是在萬那杜（Vanuatu）、瓦利斯群島和富圖那群島 （Wallis and Futuna）、玻里尼西亞（Polynesia）等遠大洋洲（Remote Oceania）等區域，卻直到3200年前才有人類的蹤跡。而法國國家科學研究中心（CNRS）、法蘭西學術院（College de France）和巴斯德研究所（Institut Pasteur）等研究人員，共同進行大洋洲的人口研究，他們研究太平洋區域台灣、菲律賓、俾斯麥群島、索羅門群島、萬那杜等20個族群，針對317名採樣個體進行全基因體定序（Whole genome sequencing, WGS）分析。透過這項研究，推斷居住在台灣的原住民，曾在5000年前進行大遷徙，其路線穿過菲律賓、印尼，最後抵達大洋洲區域。這部分稱為「南島語族大遷徙」（Austronesian expansion），但雖然推估是從5000年前就開始遷徙，但南島語族語近大洋洲的族群融合，約是從3000年才開骰，推斷遷徙應該耗費不少時間。